到了太祖死后，大福晋和她三个儿子，便成为孤儿寡妇，阿济格只有二十一岁，多尔衮十四岁，大福晋的悲惨末日跟着到来了。
据《清太祖武皇帝实录》：
（孝慈后）崩后复立兀（纳）喇国满泰贝勒女为后，饶丰姿，然心怀嫉妒，每致帝不悦，虽有机变，终为帝之明所制，留之恐后为国乱，预遗言于诸王曰：“俟吾终必令殉之。”诸王以帝遗言告后，后支吾不从。诸王曰“先帝有命，虽欲不从不可得也。”后遂服礼衣，尽以珠宝饰之，哀谓诸王曰：“吾自十二岁事先帝，丰衣美食，已二十六年，吾不忍离，故相从于地下。吾二幼子多儿哄（多尔衮）、多躲（多铎），当恩养之。”诸王泣而对曰：“二幼弟吾等若不恩养，是忘父也，岂有不恩养之理？”于是，后于十二日辛亥时自尽，寿三十七，乃与帝同柩，巳时出宫，安厝于沈阳城内西北角。又有二妃阿迹根、代因札亦殉之。
这部太祖实录是各版中最早的一种，尚未删改，这一段又很质朴地记载了一幕活生生的人间惨剧。
活人殉葬本是蛮性的遗留，这种残酷的风俗远在殷代已经盛行。郑天挺《探微集》中曾举清太宗死，二章京殉死，世祖死，栋鄂妃殉死，孝慈后死，太姐命四婢殉之，多尔衮死，侍女吴尔库尼殉死等事件。可见妻妾殉夫，奴婢殉主，是满洲的旧俗，并不限于殉君上。殉葬的理由是赴阴间去侍候主子，皇帝对后妃其实也是主子。其中有的是自愿的，有的是强迫的，自愿者恐也是极少数。太祖大臣雅荪，曾自誓欲殉葬，后又图谋逃奔，因而为太宗所杀。
但从上述《实录》首段来看：太祖恐怕大福晋日后将乱国，所以“俟吾终必令殉之”，那等于太祖预谋要杀死大福晋了，后段又谓大福晋说“吾不忍离，故相从于地上”，岂非自相矛盾，欲盖弥彰？大福晋如不死，阿济格、多尔衮的年龄虽比皇太极少，但任她的才能，使儿子践位为君，颇有可能，所以对太祖“遗命”，学者曾有怀疑。
太祖病重时，为什么又召大福晋来？是不是特地要她来殉葬？这是很难说得通的。太祖晚年，对过去幽弟杀子的举措已隐感痛心，不至再有这样忍心的“遗命”。多尔衮是他心爱的儿子，他怎么会让十四岁的儿子成为无父无母之人。他对大福晋还是有感情的，大福晋和代善有暧昧关系当是事实，要杀早就杀了。病重时要她前来，自是病量身后之事。
日本稻叶君山《清朝全史》（但焘译）第十二章，对此事曾有评论：
吾人推求其故，当由于太宗争夺汗位，出此隐谋。谓出于太祖之遗言，其实与事实上适相违反也。就朝鲜所闻，则太祖临死时谓贵永介（指代善）曰：“九王（指多尔衮）当立而年幼，汝摄位后，可传九王也。”贵永介以嫌疑，遂让洪太氏（指皇太极）。……以太祖欲以最宠所出之多尔衮继汗位，因子幼母寡，暂以长子摄位，其心苦矣。然而太宗前半生之骨肉相贼（残），祸因亦自此始。
文中的“就朝鲜所闻”，是指朝鲜人李肯翊所著《燃藜室记述》二十七记所记，但这时多尔衮地位还不高，还未成为一个旗主，所以太祖已有传位于多尔衮之意未必符合事实，不过，她的能干的生母大福晋如活下去，对皇太极自必成为一种威胁，稻叶氏推测逼上梁山继母殉死，出于皇太极争位的隐谋却是很有道理的。
总之，大福晋的被迫自尽，反映了宫闱之间十分尖锐的皇权之争，也可以说是政变的隐蔽表现。
顺治是清太宗皇太极的儿子，孝慈皇后的嫡亲孙子。多尔衮是大福晋的儿子。这两位皇后都姓纳喇氏。入关以后，她们都已身殁，而属于这两个女人系统的明争暗斗，却仍很激烈，顺治的生母，却又有下嫁多尔衮的传说。民间本有“清官难断家务事”的谚语，到了宫闱之间，又介入政权的争夺，便显得错综复杂了。
